| Crédits ECTS |
6
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| Volume horaire total |
50
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| Volume horaire CM |
12
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| Volume horaire TD |
9
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| Volume horaire TP |
29
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Pré-requis
? UE introductive à la bioinformatique (M1)
? UE Bioanalyse en génomique et transcriptomique (M1)
? UE Protéomique et métabolomique (M1)
? Connaissances en physiologie et génomique des organismes
Objectifs
Savoir analyser une situation complexe impliquant des données “omiques’ de différentes natures (génom, transcripto, proteo, metabo, biblio...) et en proposer une interprétation critique pour comprendre le fonctionnement intégré de la cellule et de l’organisme
PT招财进宝
CM : Concepts et méthodes pour l’intégration de données ? omiques ?
? Introduction à l’intégration de données Omiques
? Rappels de Transcriptomique, protéomique, métabolomique et développements connexes (interactomique, fluxomique etc.)
? Retour sur les méthodes : Fouille de données, analyses multi-blocs, graphe, text-mining...
TD : Analyse d’article et exercices pratiques pour la mise en ?uvre d’outils d’analyse de visualisation et d’intégration de données (e.g. genome viewer, mixomics, cytoscape...)
TP :Approche par projet : Prise en main d’un jeu de données hétérogène complexe, compréhension de la problématique, développement d’une solution bioinformatique (conception d’une chaine de traitements), analyse des données et interprétation dans le contexte de la problématique identifiée.
Ce projet se décline en 2 étapes :
- 1- travail individuel : analyse de la nature des données fournies, de la problématique posée et proposition d’une stratégie d’analyse intégrée (donne lieu à une note individuelle pour une évaluation en CC)
- - 2 – travail en groupe (groupes constitués par l’équipe pédagogique) : mise en ?uvre d’une solution pour le traitement et l’analyse des données fournies dans le cadre du projet (donne lieu à une note de groupe pour une évaluation en CC)
La restitution des résultats de l’analyse intégrative et de l’interprétation des données donnera lieu à une présentation orale devant une jury composé de l’ensemble de l’équipe pédagogique et des étudiants de la promotion.
Informations complémentaires
Savoir analyser une situation complexe impliquant des données “omiques’ de différentes natures (génom, transcripto, proteo, metabo, biblio...) et en proposer une interprétation critique pour comprendre le fonctionnement intégré de la cellule et de l’organisme
