Microbiologie Environnement Digestif Sant¨¦

L¡¯Unit¨¦ MEDiS (Microbiologie Environnement Digestif et Sant¨¦ ; https://www6.ara.inrae.fr/medis/), est une Unit¨¦ Mixte de Recherche entre INRAE (Institut National de Recherche pour l¡¯Agriculture, l¡¯Alimentation et l¡¯Environnement) et l'UCA (Universit¨¦ Clermont Auvergne) cr¨¦¨¦e en Janvier 2017. L'UMR454 MEDiS est g¨¦ographiquement localis¨¦e sur deux sites, le site de Theix (Centre de Recherche Clermont-Auvergne-Rh?ne-Alpes, 63122 Saint-Gen¨¨s Champanelle) et le site Dunant (Facult¨¦ de M¨¦decine et de Parapharmacie, 63000 Clermont-Ferrand).

L'Unit¨¦ MEDiS est organis¨¦e en mono-¨¦quipe et s'articule autour de quatre axes th¨¦matiques de recherche interactifs : (i) Pathog¨¨nes Alimentaires Zoonotiques (PAZ), avec l'¨¦tude de l'¨¦cophysiologie des Escherichia coli pathog¨¨nes diarrh¨¦iques (DEC), et plus g¨¦n¨¦ralement du colibiome et du microbiome associ¨¦, ainsi que de listeria monocytogenes, (ii) Fonctions M¨¦taboliques du Microbiote digestif et Dysbioses (FM2D), en particulier avec l'¨¦tude d'intrants positifs ou n¨¦gatifs comme les polyph¨¦nols et les x¨¦nobiotiques, dans des situations physiologiques ou pathologiques (syndrome de l'intestin irritable et ob¨¦sit¨¦), (iii) GAL¨¦niques INNovantes (GALINN) avec le d¨¦veloppement de nouvelles strat¨¦gies de vectorisation de probiotiques, de pr¨¦biotiques ou de substances actives et (iv) INNOvations et d¨¦veloppement de mod¨¨les in VITRO (INNOVITRO) avec le d¨¦veloppement de syst¨¨mes digestifs artificiels ou de syst¨¨mes de capture de g¨¨nes.

Les recherches de l'Unit¨¦ portent sur l'¨¦tude des interactions des microbiotes alimentaires et digestifs de l'animal et de l'Homme avec leur environnement. L'objectif principal des travaux conduits au sein de l'UMR vise ¨¤ ¨¦tudier les inter-relations entre micro-organismes intestinaux et alimentation, facteurs environnementaux et/ou agents pathog¨¨nes pouvant conduire ¨¤ diff¨¦rentes situations physio-pathologiques. Il s'agit ¨¦galement de pouvoir proposer des strat¨¦gies innovantes permettant de traiter/pr¨¦venir les d¨¦sordres microbiens impliqu¨¦s dans les ¨¦tats pathologiques ¨¦tudi¨¦s. Le microbiote est ainsi le point central commun aux diff¨¦rents axes de recherche.

L'Unit¨¦ dispose d'infrastructures exp¨¦rimentales performantes avec 4 plateaux techniques ; l'Installation Exp¨¦rimentale Microbiologie (IEM) INRAE, mettant ¨¤ disposition une animalerie gnotobiotique, le plateau UCA Partner GALBIOPHARM d¨¦di¨¦ ¨¤ l'¨¦valuation biopharmaceutique et gal¨¦nique de compos¨¦s actifs, le plateau UCA Partner DIGESTIV de simulation de l'environnement digestif humain et animal, le plateau UCA Partner CAPTURE d¨¦di¨¦ ¨¤ la capture de g¨¨nes. L'Unit¨¦ a des liens privil¨¦gi¨¦s avec des plateformes r¨¦gionales dans lesquelles des scientifiques du MEDiS ont des responsabilit¨¦s, la plateforme Auvergne Bioinformatique (AuBi), la plateforme d'exploration du m¨¦tabolisme (PFEM) et la plateforme IRICE PRIMUM (plateforme de recherche int¨¦grative en nutrition et mobilit¨¦).

L'UMR MEDiS repr¨¦sente un effectif d'environ 70 personnes dont une quarantaine de titulaires INRAE ou UCA (Directeur de Recheche, Professeur d'Universit¨¦, Charg¨¦ de Recherche, Ma?tre de Conf¨¦rence Universitaire, Ing¨¦nieur de Recherche, Ing¨¦nieur d'Etude, Assistant Ing¨¦nieur, Technicien de Recherche, Adjoint Technique Principal). Elle accueille r¨¦guli¨¨rement des doctorants et post-doctorants ainsi que des stagiaires et CDD, repr¨¦sentant en moyenne une quinzaine de contractuels par an. MEDiS accueille et collabore avec des personnels d¨¦tach¨¦s de la soci¨¦t¨¦ Lallemand, en particulier son Unit¨¦ d'Affaires Nutrition Animale, avec qui elle d¨¦veloppe depuis plus de 25 ans un partenariat de recherche privil¨¦gi¨¦ concernant l'utilisation d'additifs alimentaires pour les animaux d'¨¦levage en lien avec les th¨¨mes FM2D et PAZ.