Laboratoire de G¨¦n¨¦tique, Diversit¨¦, ?cophysiologie des C¨¦r¨¦ales
![](https://ent.uca.fr/graal_data/prod/1/34/901.jpg)
UMR 1095 / UCA
- Adresse :
- Site Crou?l
5, Chemin de Beaulieu
63039 CLERMONT-PT招财进宝
- T¨¦l :
- + 33 4 43 76 15 34
- Sur Internet :
- www6.clermont.inrae.fr/umr1095/
- Adresse :
- Campus Universitaire des C¨¦zeaux
TSA 60026 - CS 60026
1, Impasse Am¨¦lie Murat
63178 AUBIERE
- T¨¦l :
- + 33 4 43 76 15 34
- Sur Internet :
- www6.clermont.inrae.fr/umr1095/
Responsables
- Directeur de laboratoire
- Jerome SALSE
- Directeur Adjoint
- Pierre BARRET
- Directeur Adjoint
- Jacques LE GOUIS
- Directrice Adjointe
- Catherine RAVEL
- Gestionnaire d'unit¨¦
- Lucie SAVOCA lucie.savoca@uca.fr
Composition ¨¦quipe ( effectif total : 85 )
- BONHOMME Ludovic -
- BOUDET Julie -
- MARLIAC Gaelle -
- MOUZEYAR Said -
- PIQUET Agnes -
- ROCHE EYHERAGUIBEL Jane -
- STEVENS Aurelia -
- ALLARD Vincent -
- BLANCON Justin -
- BOUCHET Sophie -
- CHARMET Gilles -
- CIVAN Peter -
- LANGIN Thierry -
- LE GOUIS Jacques -
- LECARPENTIER Christophe -
- SAINTENAC Cyrille -
- SALSE Jerome -
- SANO Naoto -
- SOURDILLE Pierre -
- BARRET Pierre -
- BOUGUENNEC Annaig -
- CHOULET Frederic -
- GIROUSSE Christine -
- MARIN Pierre -
- OURY Francois Xavier -
- PONCET Charles -
- RAVEL Catherine -
- BANCEL Emmanuelle -
- BARGOIN Kevin -
- BERNARD Stephane -
- BRUN Lea -
- CALVAYRAC Catherine -
- COSTON Amelie -
- DEBITON Clement -
- DENEFLE Michael -
- DHANASEKARAN Padmapriya -
- GAUTIER Veronique -
- LASSERRE ZUBER Pauline -
- LELOUP Fabien -
- NADAUD Isabelle -
- PONT POULET Caroline -
- RANOUX Marion -
- RIMBERT Helene -
- TIXIER LEYRE Patricia -
- OZTURK Hasret -
- ALVAREZ David -
- BARDY Lionel -
- BENEDIT Stephane -
- BERNARD Nathalie -
- BLANC Richard -
- BOYER Delphine -
- CAMBON Florence -
- CARRIAS DELOCHE Marion -
- CONFOLENT Carole -
- DUPUITS Celine -
- FAYE Annie -
- GEORGES Ludovic -
- HUNEAU Cecile -
- JAFFRELO Lydia -
- KITT Jonathan -
- LHOMMET Isabelle -
- MAGNAUDET Julien -
- MARCON Dominique -
- MARTIGNAC Valerie -
- MENECIER Clara -
- MERLINO Marielle -
- PARTIER Anne -
- PERROCHON Sibille -
- PHILIPPE Geraldine -
- ROUGEOL Severine -
- SAUVAT Stephane -
- TASSY Caroline -
- ADAMIK Larissa -
- AHCHOUCH Fatima Zahra -
- AYILALATH Shimlal -
- BANOUH Meriem -
- BORJAS Aldo -
- DHANASEKARAN Padmapriya -
- DUPONT Maxime -
- FREY Caroline -
- HAQUET Camille -
- MAGLIARASCHI Ninon -
- RODRIGUES DE ARAUJO ALVES CRUZ Laila -
- SANGATA Rosie -
- UNVERICHT Marie -
Equipes
- G¨¦n¨¦tique et Recombinaison (GeCO) , Pierre SOURDILLE
- Centre de Ressources Biologiques (CRB) , Francois BALFOURIER
- Cultures des Plantes en Conditions Contr?l¨¦es (CPCC) , Stephane BERNARD
- Diversit¨¦ et G¨¦nomes (DiGen) , Etienne PAUX
- La Variance comme source de Stabilit¨¦ (VISTA) , Vincent ALLARD
- Maladies des c¨¦r¨¦ales (MDC) , Thierry LANGIN
- Pal¨¦og¨¦nomique et Evolution (Pal¨¦oEvo) , Jerome SALSE
- Plateforme de Bioinformatique (BIOINFO) , Frederic CHOULET
- Plateforme de Transg¨¦n¨¨se du Bl¨¦ (ValFon) , Pierre BARRET
- Plateforme de s¨¦quen?age et genotypage (Gentyane) , Charles PONCET
- Qualit¨¦ des grains (QualiGrain) , Jacques LE GOUIS
Th¨¨mes de Recherche
L¡¯Unit¨¦ Mixte de Recherche G¨¦n¨¦tique Diversit¨¦ Ecophysiologie des C¨¦r¨¦ales (UMR 1095 GDEC) associe l¡¯INRAE (D¨¦partements scientifiques BAP, AgroEnv, SPE, Centre Clermont Auvergne ¨C Rh?ne-Alpes) et l¡¯Universit¨¦ Clermont-Auvergne (UFR de Biologie, Collegium ? Sciences de la Vie, Sant¨¦, Environnement ?). Localis¨¦e sur le site Inrae de Crou?l (Clermont-Fd) et sur le Campus Universitaire des C¨¦zeaux (Aubi¨¨re), elle compte 80 permanents (68 Inra, 8 UCA, 3 VAS, 1 CNRS) et 30 ¨¤ 40 non permanents (Doctorants, Post-Doctorants, CDD, visiteurs). Elle est rattach¨¦e ¨¤ l¡¯Ecole Doctorale 65 Sciences de la Vie, Sant¨¦, Agronomie, Environnement, et impliqu¨¦e dans diff¨¦rentes formations, dont le Master de Biologie V¨¦g¨¦tale Plant Integrative Biology & Breeding (PIBB) et le Master de Microbiologie.
Les projets, d¨¦velopp¨¦s au sein de 6 ¨¦quipes de recherche aux th¨¦matiques interconnect¨¦es, sont focalis¨¦s sur le bl¨¦ tendre, esp¨¨ce mod¨¨le et d¡¯importance agronomique (2¨¨me c¨¦r¨¦ale au niveau mondial). A l¡¯interface entre recherche fondamentale et recherche finalis¨¦e, leur objectif commun est l¡¯am¨¦lioration de la qualit¨¦ et du rendement du bl¨¦ dans un contexte de transition agro¨¦cologique et de changements climatiques, avec comme principaux objectifs : (1) Progresser dans la connaissance de la structure, de l¡¯organisation, du fonctionnement et de l¡¯¨¦volution du g¨¦nome du bl¨¦ tendre, comprendre la gen¨¨se de nouvelles fonctions et/ou l¡¯¨¦volution de fonctions conserv¨¦es sp¨¦cifiques au cours de l¡¯histoire ¨¦volutive du bl¨¦ et plus largement des c¨¦r¨¦ales. (2) D¨¦crypter et mod¨¦liser les m¨¦canismes mol¨¦culaires et physiologiques impliqu¨¦s dans le contr?le de caract¨¨res agronomiques importants tels que rendement, qualit¨¦ du grain et r¨¦sistance/tol¨¦rance ¨¤ des stress biotiques (maladies) ou abiotiques (d¨¦ficience en azote, en soufre, changements climatiques, ¡). (3) Analyser et valoriser les ressources g¨¦n¨¦tiques, (4) Contribuer au d¨¦veloppement de nouveaux outils et m¨¦thodes de s¨¦lection (S¨¦lection g¨¦nomique), et int¨¦grer les connaissances acquises dans des mod¨¨les pour am¨¦liorer l¡¯efficacit¨¦ de la s¨¦lection vari¨¦tale. Ces projets s¡¯inscrivent dans les objectifs du Challenge 1 ? Concevoir et piloter des agro¨¦cosyst¨¨mes durables dans un contexte de changement global ? du projet I-SITE Clermont CAP 20-25.
L¡¯UMR GDEC dispose d¡¯infrastructures exp¨¦rimentales dot¨¦es des ¨¦quipements les plus r¨¦cents : Plateforme Strat¨¦gique Nationale Gentyane (S¨¦quen?age et g¨¦notypage haut d¨¦bit), Plateforme de Validation Fonctionnelle (transg¨¦n¨¨se bl¨¦s, collections de mutants, Genome Editing), Plateforme de production de mat¨¦riel v¨¦g¨¦tal en conditions contr?l¨¦es (enceintes et chambres climatiques, 1300 m2 de serres conventionnelles, 1000 m2 de serres S2), Centre de Ressources Biologiques C¨¦r¨¦ales ¨¤ paille (~27000 accessions), Plateforme de Bioinformatique, Service d¡¯Appui (gestion administrative, financi¨¨re, RH). Les exp¨¦rimentations en plein champ sont r¨¦alis¨¦es en collaboration avec l¡¯Unit¨¦ Exp¨¦rimentale INRAE PHACC, l¡¯UMR et l¡¯UE assurant la gestion de la Plateforme de Ph¨¦notypage haut d¨¦bit Pheno3C, qui permet l¡¯¨¦tude en condition de plein champ des interactions g¨¦notype x environnement, et de tester l¡¯impact de param¨¨tres clefs du changement climatique (stress hydrique, [CO2] atmosph¨¦rique).
Consid¨¦r¨¦e aujourd¡¯hui comme un leader incontournable en g¨¦nomique et g¨¦n¨¦tique des c¨¦r¨¦ales au niveau international, l¡¯UMR GDEC a d¨¦velopp¨¦ un r¨¦seau tr¨¨s dense de collaborations avec des partenaires acad¨¦miques et priv¨¦s.
Publications ( HAL )
- Using crop growth model stress covariates and AMMI decomposition to better predict genotype-by-environment interactions
Renaud Rincent , Marcos Malosetti , Behnam Ababaei , Gaetan Touzy , Agathe Mini , M. Bogard , Pierre Martre , Jacques Le Gouis , F. van Eeuwijk - Bl¨¦ en association de l¨¦gumineuses : int¨¦r¨ºts et limites des services rendus au bl¨¦
Agn¨¨s Piquet-Pissaloux , M. Sartre , Loric Thoulouze , Y. Hallaoui , V. Rouillon , C. Gouttebel - Phenomic Selection: A new and efficient alternative to genomic selection.
Pauline Robert , Charlotte Brault , Renaud Rincent , Vincent Segura - Comparison of genomic-enabled cross selection criteria for the improvement of inbred line breeding populations
Alice Danguy Des D¨¦serts , Nicolas Durand , Bertrand Servin , Ellen Goudemand-Dugu¨¦ , Jean-Marc Alliot , Daniel Ruiz , Gilles Charmet , Jean-Michel Elsen , Sophie Bouchet - High-Resolution Mapping of Crossover Events in the Hexaploid Wheat Genome Suggests a Universal Recombination Mechanism
Benoit Darrier , H¨¦l¨¨ne Rimbert , Fran?ois Balfourier , Lise Pingault , Ambre-Aurore Josselin , Bertrand Servin , Julien Navarro , Fr¨¦d¨¦ric Choulet , Etienne Paux , Pierre Sourdille - Association bl¨¦/l¨¦gumineuses : l¡¯importance des vari¨¦t¨¦s et des esp¨¨ces
Agn¨¨s Piquet , R. Kedjem , V. Rouillon , C. Gouttebel - Extraction d'information pour la s¨¦lection du bl¨¦ par marqueur g¨¦n¨¦tique
Dialekti Valsamou , Robert Bossy , Marion Ranoux , Wiktoria Golik , Pierre Sourdille , Claire N¨¦dellec - Analyse et caract¨¦risation du r?le des prot¨¦ines SPO11-2 du bl¨¦ tendre impliqu¨¦es dans l¡¯initiation de la recombinaison m¨¦iotique
Fatiha Benyahya - Genetic erosion in domesticated barley and a hypothesis of a North African centre of diversity
Peter Civ¨¢¨¾ , Agostino Fricano , Joanne Russell , Caroline Pont , Hakan ?zkan , Benjamin Kilian , Terence A Brown - Stomatal penetration: the cornerstone of plant resistance to the fungal pathogen Zymoseptoria tritici
M¨¦lissa Battache , Marta Suarez-Fernandez , Madison Van¡¯t Klooster , Florence Cambon , Andrea S¨¢nchez-Vallet , Marc-Henri Lebrun , Thierry Langin , Cyrille Saintenac