Laboratoire de G¨¦n¨¦tique, Diversit¨¦, ?cophysiologie des C¨¦r¨¦ales

L¡¯Unit¨¦ Mixte de Recherche G¨¦n¨¦tique Diversit¨¦ Ecophysiologie des C¨¦r¨¦ales (UMR 1095 GDEC) associe l¡¯INRAE (D¨¦partements scientifiques BAP, AgroEnv, SPE, Centre Clermont Auvergne ¨C Rh?ne-Alpes) et l¡¯Universit¨¦ Clermont-Auvergne (UFR de Biologie, Collegium ? Sciences de la Vie, Sant¨¦, Environnement ?). Localis¨¦e sur le site Inrae de Crou?l (Clermont-Fd) et sur le Campus Universitaire des C¨¦zeaux (Aubi¨¨re), elle compte 80 permanents (68  Inra, 8 UCA, 3 VAS, 1 CNRS) et 30 ¨¤ 40 non permanents (Doctorants, Post-Doctorants, CDD, visiteurs). Elle est rattach¨¦e ¨¤ l¡¯Ecole Doctorale 65 Sciences de la Vie, Sant¨¦, Agronomie, Environnement, et impliqu¨¦e dans diff¨¦rentes formations, dont le Master de Biologie V¨¦g¨¦tale Plant Integrative Biology & Breeding (PIBB) et le Master de Microbiologie.

Les projets, d¨¦velopp¨¦s au sein de 6 ¨¦quipes de recherche aux th¨¦matiques interconnect¨¦es, sont focalis¨¦s sur le bl¨¦ tendre, esp¨¨ce mod¨¨le et d¡¯importance agronomique (2¨¨me c¨¦r¨¦ale au niveau mondial). A l¡¯interface entre recherche fondamentale et recherche finalis¨¦e, leur objectif commun est l¡¯am¨¦lioration de la qualit¨¦ et du rendement du bl¨¦ dans un contexte de transition agro¨¦cologique et de changements climatiques, avec comme principaux objectifs : (1) Progresser dans la connaissance de la structure, de l¡¯organisation, du fonctionnement et de l¡¯¨¦volution du g¨¦nome du bl¨¦ tendre, comprendre la gen¨¨se de nouvelles fonctions et/ou l¡¯¨¦volution de fonctions conserv¨¦es sp¨¦cifiques au cours de l¡¯histoire ¨¦volutive du bl¨¦ et plus largement des c¨¦r¨¦ales. (2) D¨¦crypter et mod¨¦liser les m¨¦canismes mol¨¦culaires et physiologiques impliqu¨¦s dans le contr?le de caract¨¨res agronomiques importants tels que rendement, qualit¨¦ du grain et r¨¦sistance/tol¨¦rance ¨¤ des stress biotiques (maladies) ou abiotiques (d¨¦ficience en azote, en soufre, changements climatiques, ¡­). (3) Analyser et valoriser les ressources g¨¦n¨¦tiques, (4) Contribuer au d¨¦veloppement de nouveaux outils et m¨¦thodes de s¨¦lection (S¨¦lection g¨¦nomique), et int¨¦grer les connaissances acquises dans des mod¨¨les pour am¨¦liorer l¡¯efficacit¨¦ de la s¨¦lection vari¨¦tale. Ces projets s¡¯inscrivent dans les objectifs du Challenge 1 ? Concevoir et piloter des agro¨¦cosyst¨¨mes durables dans un contexte de changement global ? du projet I-SITE Clermont CAP 20-25.

L¡¯UMR GDEC dispose d¡¯infrastructures exp¨¦rimentales dot¨¦es des ¨¦quipements les plus r¨¦cents : Plateforme Strat¨¦gique Nationale Gentyane (S¨¦quen?age et g¨¦notypage haut d¨¦bit), Plateforme de Validation Fonctionnelle (transg¨¦n¨¨se bl¨¦s, collections de mutants, Genome Editing), Plateforme de production de mat¨¦riel v¨¦g¨¦tal en conditions contr?l¨¦es (enceintes et chambres climatiques, 1300 m2 de serres conventionnelles, 1000 m2 de serres S2), Centre de Ressources Biologiques C¨¦r¨¦ales ¨¤ paille (~27000 accessions), Plateforme de Bioinformatique, Service d¡¯Appui (gestion administrative, financi¨¨re, RH). Les exp¨¦rimentations en plein champ sont r¨¦alis¨¦es en collaboration avec l¡¯Unit¨¦ Exp¨¦rimentale INRAE PHACC, l¡¯UMR et l¡¯UE assurant la gestion de la Plateforme de Ph¨¦notypage haut d¨¦bit Pheno3C, qui permet l¡¯¨¦tude en condition de plein champ des interactions g¨¦notype x environnement, et de tester l¡¯impact de param¨¨tres clefs du changement climatique (stress hydrique, [CO2] atmosph¨¦rique).

Consid¨¦r¨¦e aujourd¡¯hui comme un leader incontournable en g¨¦nomique et g¨¦n¨¦tique des c¨¦r¨¦ales au niveau international, l¡¯UMR GDEC a d¨¦velopp¨¦ un r¨¦seau tr¨¨s dense de collaborations avec des partenaires acad¨¦miques et priv¨¦s.