M¨¦tabolismes microbiens: diversit¨¦ et r?les

Ma?triser les techniques et concepts de base de microbiologie (manipulations st¨¦riles, ensemencement de milieux,¡­)

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Cours magistraux
- Ecologie microbienne : M¨¦tabolismes bact¨¦riens, les bact¨¦ries photosynth¨¦tiques. La chimiolithotrophie. La vie sans oxyg¨¨ne. La d¨¦gradation des compos¨¦s complexes.
- Structure et ¨¦volution des g¨¦nomes microbiens : Structure du chromosome bact¨¦rien. El¨¦ments extra-chromosomiques et comp¨¦tence bact¨¦rienne. Relation entre m¨¦tabolisme et plasticit¨¦ g¨¦nomique. Relation avec l¡¯identification bact¨¦rienne.
Travaux Dirig¨¦s
Pr¨¦paration aux TPs :
- M¨¦tabolismes bact¨¦riens : exemple de la colonne de Winogradsky (1.5 h)
- Transformation bact¨¦rienne : exemple de modification g¨¦n¨¦tique (1.5 h)
Travaux pratiques
- M¨¦tabolismes bact¨¦riens : Isolement de micro-organismes m¨¦taboliquement diff¨¦rents pr¨¦sents dans la colonne de Winogradsky : Photosynth¨¨se, respiration, sulfato-r¨¦duction, m¨¦thanog¨¦n¨¨se¡­ et identification mol¨¦culaire.
- Production d¡¯une prot¨¦ine fluorescente en syst¨¨me h¨¦t¨¦rologue bact¨¦rien.

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