Intestinal Microbiota, Nutrition, Immunity

Basic courses (Bachelor's level) in microbiology and cell biology. S1 lecture: Intestinal Microbiota, digestive system and pathologies. L¡¯¨¦tudiant devra avoir suivi des enseignements de base (niveau Licence) en microbiologie et biologie cellulaire, et le module Microbiote Intestinal, Environnement digestif et Pathologies du S1.

Acquire deep knowledge of the relationships between the intestinal microbiota, the immune system, nutrition and diseases in humans; understand the design of innovative therapeutic approaches. Poursuivre l¡¯acquisition des connaissances indispensables ¨¤ la compr¨¦hension des liens entre microbiote intestinal et pathologies, et ¨¤ la conception d¡¯approches th¨¦rapeutiques innovantes. Conna?tre et ma?triser les strat¨¦gies scientifiques et les techniques mises en ?uvre pour analyser les liens entre microbiote intestinal, immunit¨¦, nutrition et pathologies, ainsi que les m¨¦canismes d¡¯action des probiotiques/pr¨¦biotiques.

Courses will include (i) lectures exploring the gut microbiome:
- Relationship between intestinal microbiota and diseases,
- Design of innovative therapies,
(ii) Tutorials to illustrate the course by analyzing recent scientific papers.

Cours magistraux
The lectures will explore some of the following themes (depending on recent scientific papers and clinical news):
Relationship between intestinal microbiota and diseases:
- Microbiota and Muscle Function;
- Microbiota and Obesity / Metabolic diseases;
- Chronic inflammatory bowel disease (IBD) and dysbiosis;
- Microbiota and Colorectal Cancer;
- Microbiota and visceral sensitivity, Irritable Bowel Syndrome (IBS) / Functional bowel disorders;
- Microbiota in the Gut Brain axis;
- Microbiota and Allergies (immunological mechanisms of allergy, microbiota-allergies link,
oral immunotherapy / food allergy, prevention of allergies with probiotics)
- Microbiota and Respiratory Function (Gut Lung axis);
- Microbiota and aging.
Design of innovative therapies:
- Mechanisms of action of Probiotics / Prebiotics; regulatory aspects
- Pathologies and fecal transplantation
- Use of recombinant microorganisms in the digestive tract


L¡¯enseignement comportera (i) une partie th¨¦orique permettant de poursuivre l¡¯acquisition des connaissances indispensables ¨¤ la compr¨¦hension :
- des liens entre microbiote intestinal et pathologies,
- des m¨¦canismes li¨¦s ¨¤ la conception de th¨¦rapeutiques innovantes,
(ii) des enseignements dirig¨¦s permettant d¡¯illustrer le cours de fa?on concr¨¨te par l¡¯analyse de publications r¨¦centes.
Les cours magistraux et les TD permettront de d¨¦velopper certains des th¨¨mes suivants (en fonction des publications r¨¦centes et de l¡¯actualit¨¦ scientifique et clinique) :
Liens entre microbiote intestinal et pathologies :
- Microbiote et Fonction musculaire ;
- Microbiote et Ob¨¦sit¨¦ / Maladies m¨¦taboliques ;
- Maladies inflammatoires Chroniques de l¡¯Intestin (MICI) et dysbiose ;
- Microbiote et Cancer Colorectal ;
- Microbiote et sensibilit¨¦ visc¨¦rale, Syndrome de l¡¯Intestin Irritable (SII) /Troubles fonctionnels intestinaux (TFI) ;
- Microbiote et Cerveau (Gut Brain axis) ;
- Microbiote et Allergies (m¨¦canismes immunologiques de l'allergie, lien microbiote-allergies,
immunoth¨¦rapie orale/allergie alimentaire, pr¨¦vention des allergies par les probiotiques)
- Microbiote et Fonction Respiratoire (Gut Lung axis) ;
- Microbiote et vieillissement.
Conception de th¨¦rapeutiques innovantes :
- M¨¦canismes d¡¯action des Probiotiques / Pr¨¦biotiques ; aspects r¨¦glementaires
- Pathologies et transplantation f¨¦cale
- Utilisation de microorganismes recombinants dans l¡¯¨¦cosyst¨¨me digestif

Travaux Dirig¨¦s
The tutorials will illustrate and deepen the theoretical course with applications chosen from recent scientific papers. Train students to scientific analysis: know how to interpret, exploit and criticize results; learn how to present them.
Les travaux dirig¨¦s permettront d¡¯illustrer et d¡¯approfondir le cours th¨¦orique ¨¤ l¡¯aide d¡¯applications concr¨¨tes choisies dans des publications r¨¦centes, et de former les ¨¦tudiants ¨¤ la r¨¦flexion scientifique par l¡¯¨¦tude des strat¨¦gies de recherche et des approches exp¨¦rimentales.

Acquire deep knowledge of the relationships between the intestinal microbiota, the immune system, nutrition and diseases in humans; understand the design of innovative therapeutic approaches. Poursuivre l¡¯acquisition des connaissances indispensables ¨¤ la compr¨¦hension des liens entre microbiote intestinal et pathologies, et ¨¤ la conception d¡¯approches th¨¦rapeutiques innovantes. Conna?tre et ma?triser les strat¨¦gies scientifiques et les techniques mises en ?uvre pour analyser les liens entre microbiote intestinal, immunit¨¦, nutrition et pathologies, ainsi que les m¨¦canismes d¡¯action des probiotiques/pr¨¦biotiques.