Nature UE
Cr¨¦dits ECTS 3
Volume horaire total 27
Volume horaire CM 15
Volume horaire TD 12

Pr¨¦-requis

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Objectifs

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PT招财进宝

Cours magistraux
1) Structure et fonctions des g¨¨nes et des g¨¦nomes microbiens
Structure des g¨¦nomes : microorganismes eucaryotes, procaryotes, virus ; chromatine, chromosomes ; r¨¦gions codantes, non codantes et fonctions associ¨¦es
Organisation des g¨¨nes : unit¨¦ transcriptionnelle, recouvrement, synt¨¦nie, ?lots de pathog¨¦nicit¨¦ ; limites des s¨¦quences codantes ; introns/exons ; r¨¦gulation : ¨¦l¨¦ments agissant en cis, facteurs agissant en trans ; RNAi
2) Evolution des g¨¦nomes microbiens
Evolution mol¨¦culaire des g¨¦nomes : r¨¦plication, r¨¦paration et mutation ; recombinaison, duplication, brassage d¡¯exons, conversion g¨¦nique, transfert horizontal de g¨¨nes ; r¨¦arrangements ¨¤ grande ¨¦chelle, plo?die
Expansion /r¨¦duction des g¨¦nomes : des eucaryotes unicellulaires libres aux parasites
Transmission horizontale d¡¯ADN bact¨¦rien : transformation, conjugaison, transduction, transpositions et ¨¦l¨¦ments mobiles (int¨¦grons, ilots, ICE¡­)
G¨¦nomes des organites : cas des apicoplastes, des organites apparent¨¦s aux mitochondries (hydrog¨¦nosomes, mitosomes)
3) Approches exp¨¦rimentales de g¨¦nomique fonctionnelle
G¨¦n¨¦tique "forward et reverse" : vecteurs et clonage, expression h¨¦t¨¦rologue, mutag¨¦n¨¨se, banques de g¨¨nes, ARN interf¨¦rence
Le syst¨¨me CRISPR/CAS
4) G¨¦n¨¦tique des populations
D¨¦finition d¡¯une population, ¨¦volution des populations, diff¨¦rentes formes de s¨¦lection, signatures mol¨¦culaires de la s¨¦lection, d¨¦rive g¨¦n¨¦tique, marqueurs de polymorphisme g¨¦n¨¦tique, indices de diversit¨¦, notions de taille efficace, dynamique des populations microbiennes et liens avec l¡¯¨¦pid¨¦miologie des maladies infectieuses
Travaux Dirig¨¦s
Analyses de publications ou d¡¯extraits de publications scientifiques ayant trait aux th¨¦matiques abord¨¦es dans les cours magistraux. Mettre en ?uvre une d¨¦marche d¡¯interpr¨¦tation des r¨¦sultats et de comparaison par rapport ¨¤ d¡¯autres donn¨¦es.

Informations compl¨¦mentaires

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