Biofilms dans les effluents hospitaliers : carrefours d¡¯¨¦changes potentiels pour les r¨¦sistances aux antibiotiques ?

La r¨¦sistance aux antibiotiques constitue aujourd¡¯hui l¡¯une des plus graves menaces pesant sur la sant¨¦ mondiale, la s¨¦curit¨¦ alimentaire et le d¨¦veloppement. Les antibiotiques permettent de contrer les bact¨¦ries responsables de nombreuses maladies mais leur utilisation engendre ¨¦galement une pression de s¨¦lection favorisant l¡¯¨¦mergence de bact¨¦ries r¨¦sistantes. Ces ph¨¦nom¨¨nes de r¨¦sistance apparaissent spontan¨¦ment par mutations g¨¦n¨¦tiques ou sont acquis via la transmission de fragments d¡¯ADN de bact¨¦rie ¨¤ bact¨¦rie, un moyen de propagation tr¨¨s efficace. La m¨¦decine est confront¨¦e ¨¤ une course poursuite entre la d¨¦couverte de nouvelles mol¨¦cules et l¡¯apparition de r¨¦sistances, y compris vis-¨¤-vis des mol¨¦cules de derni¨¨re ligne, restreintes ¨¤ un usage hospitalier telle que l¡¯imip¨¦n¨¨me, de la famille des carbap¨¦n¨¨mes utilis¨¦ lors d¡¯infections urinaires, de pneumonies, ou de bact¨¦ri¨¦mies. La r¨¦sistance ¨¤ cette mol¨¦cule est due ¨¤ la production par les bact¨¦ries d¡¯enzymes de d¨¦gradation (les carbap¨¦n¨¦mases) et les g¨¨nes responsables de leur synth¨¨se peuvent s¡¯¨¦changer entre bact¨¦ries.

Dans ce travail, nous avons recherch¨¦ la pr¨¦sence de bact¨¦ries r¨¦sistantes ¨¤ l'imip¨¦n¨¨me, dans les effluents de l'h?pital universitaire de Clermont-Ferrand, plus pr¨¦cis¨¦ment dans les biofilms -une communaut¨¦ de microorganismes regroup¨¦s dans une matrice adh¨¦sive et protectrice se d¨¦veloppant sur les surfaces -se formant dans les conduits. Nous avons ainsi mis en ¨¦vidence une quarantaine de bact¨¦ries r¨¦sistantes ¨¤ l¡¯Imip¨¦n¨¨me, qui, de plus, pr¨¦sentaient des r¨¦sistances ¨¤ de nombreux autres antibiotiques (aminoglycosides, fluoroquinolones, t¨¦tracycline). Nous avons ¨¦galement montr¨¦ que certains g¨¨nes de r¨¦sistances ¨¤ l¡¯imip¨¦n¨¨me ¨¦taient port¨¦s par des fragments d¡¯ADN transmissibles entre bact¨¦ries. En parall¨¨le, le recueil des informations concernant l¡¯utilisation de cet antibiotique dans cet h?pital a permis d¡¯¨¦tablir une valeur pr¨¦dictive du quotient de danger, une donn¨¦e qui permet de d¨¦finir le risque de d¨¦veloppement de la r¨¦sistance. Le taux sup¨¦rieur ¨¤ 1,0 correspond ¨¤ un risque potentiel. La dilution par les effluents urbains, au niveau de la station d¡¯¨¦puration, diminue cependant ce risque.

La pr¨¦sence de g¨¨nes codant des carbap¨¦n¨¦mases dans les bact¨¦ries de biofilms d'effluents hospitaliers et leur capacit¨¦ de transfert constituent donc un danger potentiel ¨¤ ne pas n¨¦gliger et soulignent la n¨¦cessit¨¦ de surveiller la r¨¦sistance aux antibiotiques dans les eaux us¨¦es hospitali¨¨res.