Diversit¨¦ et dynamique fongiques lors de l'immersion ¨¤ long terme de plastiques conventionnels et biod¨¦gradables dans l'environnement marin
Br¨¨ve scientifique - . En utilisant une approche de m¨¦tabarcodage ciblant deux marqueurs g¨¦n¨¦tiques, des chercheurs de l'Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF) ont mis en ¨¦vidence que les communaut¨¦s fongiques associ¨¦es aux polym¨¨res plastiques ¨¦taient distinctes de celles trouv¨¦es dans l'eau de mer environnante.
Les d¨¦chets plastiques sont associ¨¦s ¨¤ une crise mondiale, avec de forts impacts n¨¦gatifs sur les ¨¦cosyst¨¨mes terrestres et aquatiques. Dans les milieux marins, divers organismes colonisent les d¨¦bris plastiques, mais peu d'¨¦tudes se sont concentr¨¦es sur les communaut¨¦s fongiques malgr¨¦ leurs r?les ¨¦cologiques non n¨¦gligeables dans le milieu marin. Dans cette ¨¦tude, diff¨¦rents types de plastiques (biod¨¦gradables et conventionnels) immerg¨¦s dans des milieux naturels marins et dans des environnements contr?l¨¦s en laboratoire ont ¨¦t¨¦ collect¨¦s apr¨¨s une colonisation ¨¤ long terme.
En utilisant une approche de m¨¦tabarcodage ciblant deux marqueurs g¨¦n¨¦tiques, ¨¤ savoir la r¨¦gion ITS2 et la r¨¦gion hypervariable V4 du g¨¨ne ARNr 18S, les chercheurs ont mis en ¨¦vidence que les communaut¨¦s fongiques associ¨¦es aux polym¨¨res plastiques ¨¦taient distinctes de celles trouv¨¦es dans l'eau de mer environnante. Ils diff¨¦raient ¨¦galement significativement entre les lieux d'¨¦chantillonnage et la nature des polym¨¨res immerg¨¦s, indiquant que la colonisation fongique ¨¦tait impact¨¦e par les sites et les types de plastiques, avec de nettes dissemblances entre les polym¨¨res conventionnels et biod¨¦gradables.
Sp¨¦cifiquement pour le polym¨¨re PVC conventionnel (polychlorure de vinyle), les chercheurs de l'ICCF ont ¨¦galement observ¨¦ les ¨¦tapes successives de d¨¦veloppement et de maturation du biofilm apr¨¨s une immersion de longue dur¨¦e dans l'eau de mer. Un changement notable dans les communaut¨¦s fongiques a ¨¦t¨¦ observ¨¦ environ 30 ¨¤ 40 jours en milieu naturel, sugg¨¦rant une dynamique de colonisation probablement associ¨¦e ¨¤ une transition de la formation de biofilm ¨¤ des communaut¨¦s distinctes probablement associ¨¦es ¨¤ l'encrassement biologique. Globalement, cette ¨¦tude renforce l'id¨¦e que le r¨¨gne fongique fait partie int¨¦grante de la "plastisph¨¨re".
- D'apr¨¨s la publication Fungal Diversity and Dynamics during Long-Term Immersion of Conventional and Biodegradable Plastics in the Marine Environment, Journal Diversity, Volume 15 (4), 2023, 1424
- Auteurs : Aur¨¦lie Philippe, Cyril No?l , Boris Eyheraguibel, Jean-Fran?ois Briand , Ika Paul-Pont, Jean-Fran?ois Ghiglione, Emmanuel Coton and Ga?tan Burgaud
- DOI : https://doi.org/10.3390/d15040579
- Mots clefs : biodegradable vs. conventional plastics