Le 3 avr. 2023
Sciences de la mati¨¨re
Analyse comparative de la diversit¨¦ bact¨¦rienne dans les nuages et les a¨¦rosols
Publi¨¦ le 22 mai 2023 – Mis ¨¤ jour le 25 mai 2023
Br¨¨ve scientifique - Zoom sur un article paru r¨¦cemment dans la revue scientifique "Atmospheric environment" impliquant notamment plusieurs chercheurs de l'Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF / UCA).
Alors que la pr¨¦sence d'eau condens¨¦e dans les nuages ??pourrait avoir une influence sur la diversit¨¦ des bact¨¦ries circulant dans la haute atmosph¨¨re, les a¨¦rosols et les nuages ??ont ¨¦t¨¦ relativement peu ¨¦tudi¨¦s en termes de contenu microbiologique. Dans ce travail, nous avons ¨¦tudi¨¦ la diversit¨¦ bact¨¦rienne a¨¦roport¨¦e recueillie tout au long de l'ann¨¦e sur un site de haute montagne lors de situations m¨¦t¨¦orologiques nuageuses et claires. Des ¨¦chantillons ont ¨¦t¨¦ pr¨¦lev¨¦s ¨¤ l'aide d'impacteurs ¨¤ haut d¨¦bit pour examiner les concentrations totales de cellules et d'ADN, ainsi que la diversit¨¦ bact¨¦rienne par s¨¦quen?age ¨¤ haut d¨¦bit. Dans l'ensemble, une diversit¨¦ bact¨¦rienne tr¨¨s similaire a ¨¦t¨¦ observ¨¦e dans les nuages ??et l'air clair, avec jusqu'¨¤ 73,8 % de la richesse partag¨¦e au niveau de la variante de s¨¦quence d'amplicon (ASV). La diversit¨¦ bact¨¦rienne ¨¦tait plus variable entre les dates d'¨¦chantillonnage en l'absence de nuages ??en raison d'une gamme plus large de conditions m¨¦t¨¦orologiques, mais au sein des masses d'air individuelles, les situations nuageuses ¨¦taient plus h¨¦t¨¦rog¨¨nes en raison des proportions plus ¨¦lev¨¦es de taxons ¨¤ faible abondance. Certains taxons se sont r¨¦v¨¦l¨¦s plus abondants dans les nuages ??par rapport aux situations claires, comme Staphylococcus, Acinetobacter, Kocuria et Enhydrobacter, ou ¨¤ l'inverse, comme Bacillus. ? l'exception de Kocuria, ceux-ci pourraient tous ¨ºtre expliqu¨¦s par des facteurs concomitants autres que la pr¨¦sence de nuages, c'est-¨¤-dire la saison et l'altitude de la couche limite atmosph¨¦rique. Ce travail souligne que les assemblages bact¨¦riens en suspension dans l'air sont r¨¦gis par de nombreux facteurs environnementaux interconnect¨¦s difficilement distinguables les uns des autres. Les pr¨¦l¨¨vements r¨¦pliqu¨¦s permettent de d¨¦crypter leurs r?les respectifs, et cette pratique doit ¨ºtre g¨¦n¨¦ralis¨¦e dans le domaine de l'a¨¦robiologie.
La publication s'intitule "Comparative analysis of bacterial diversity in clouds and aerosols"
Auteurs : Rapha?lle P¨¦guilhan, Florent Rossi, Olivier Ru¨¦, Muriel Joly, Pierre AmatoJournal : Atmospheric Environment, Volume 298, 2023, 119635,
Lien vers la publication : https://doi.org/10.1016/j.atmosenv.2023.119635
Mots Clef : Bioa¨¦rosols ; Nuages ; Atmosph¨¨re ; Diversit¨¦ Bact¨¦rienne